安徽醫(yī)科大學臨床醫(yī)學院是2003年由安徽醫(yī)科大學創(chuàng)建，是經(jīng)國家教育部和安徽省人民政府批準設(shè)立的獨立學院；是安徽省納入第二批本科錄取的全日制普通高等教育本科院校。1926年5月，郭琦元、湯蠡舟等在上海市原亞東醫(yī)科大學的校址上（上海市滬軍營）創(chuàng)辦上海東南醫(yī)科大學（安徽醫(yī)科大學前身）。1952年遷至省會合肥市現(xiàn)址，更名為安徽醫(yī)學院。1985年更名為安徽醫(yī)科大學。2003年經(jīng)國家教育部和安徽省人民政府批準，由安徽醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院投資，安徽醫(yī)科大學與安徽醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院合作舉辦，在合肥市經(jīng)開區(qū)翡翠路15號創(chuàng)建了安徽醫(yī)科大學臨床醫(yī)學院，目前學校總體占地面積1379畝。